Υπάρχουν πολλά ιδρύματα τριτοβάθμιας εκπαίδευσης που βρίσκονται σε όλο το Πουέρτο Ρίκο, με το Πανεπιστήμιο του Πουέρτο Ρίκο είναι το παλαιότερο και μεγαλύτερο. Ως έδαφος των Ηνωμένων Πολιτειών, οι πολίτες μπορούν να έχουν πρόσβαση σε επιπλέον ευκαιρίες για εκπαίδευση.

Μετά την ολοκλήρωση ενός πτυχίου, οι φοιτητές έχουν την επιλογή να αποκτήσουν ένα μεταπτυχιακό δίπλωμα, που βοηθάει στην παροχή πιο εις βάθος γνώσεων σε έναν συγκεκριμένο κλάδο. Πολλοί φοιτητές επιλέγουν να ολοκληρώσουν αυτό το εκπαιδευτικό πρόγραμμα για να βελτιώσουν τις προοπτικές εργασίας τους ή να εξειδικεύσουν το σύνολο δεξιοτήτων τους στον χώρο εργασίας τους.